A 23. században megkezdõdött a környezõ Naprendszerek felderítése. Az ezalatt történt felfedezések beváltották az emberek titkos vágyait. Mégpedig azt, hogy rajtunk kívül létezik fejlett idegen civilizáció, de sajnos mint késõbb kiderült, az idegenek egyik naprendszerbõl a másikra járnak és elpusztítanak minden életet. A három társaság - amely a Földrõl indult - megkezdte a Hedoth faj által hátrahagyott technológiák átvizsgálását. Az évezredekkel korábbról származó leletek alapján elkészítették - az új technológián alapuló - irányító központokat és az általuk mûködtetet combotokat. Ez a hármas szövetség további kutatásokat végzett a környezõ bolygókon, amelyek feltételezhetõen egykor a Hedoth faj otthonául szolgált. A földetérés után, csak az egykor hatalmas civilizáció maradványit találták meg. Az emberiség újból magára maradt... A három Angelus testvér szállt le az egyik bolygóra, a Rimtech kutatócsoport élén, ahol felfedeztek néhány olyan eszközt, ami még mûködõképes volt. Ezeknek az eszközöknek a birtoklásáért folyó vita, elõször a hármas szövetség felbomlásához, majd késõbb háborúhoz vezetett. Az elsõ összecsapás alkalmával a három Angelus testvér útja szétvált... A súlyosan sérült Stefan Angelusra a Mil-Agro egységei találtak rá, amely így egy jól felkészült combot-pilótára tett szert. Jonuis Angelus egy mûködõ Hedoth combot-kart elvitt Neuropának, akik ennek a leletnek köszönhetõen, jóval elõbbre járnak a Hedoth technológia alkalmazásában, mint a többi társaság. Diego Angelus, a legidõsebb testvér a Rimtech-hez tért vissza, ahol a már megkezdett feladatait folytatta, annak érdekében, hogy méltó legyen apja hírnevéhez és helyreállítsa a család becsületét...

Az emberiség jövõjét sokféleképpen lehet elképzelni, mégis csak néhány olyan akad, aminek nagyszámban akadnak követõi. Egyik közülük a Metal Fatigue-ben megjelenõ, már befogadott világkép. A játék, a már megszokott, a stratégiai-játékok hagyományos elemeibõl épül fel: nyersanyag gyûjtés, építés, gyártás, fejlesztés. Azonban ez igencsak kevéske lenne ahhoz, ami egy igazán jó programnak szüksége van. A katonai hadviselésekhez és távoli világok megközelítéséhez új fegyver áll az emberiség rendelkezésére. Ezek a pilóták által irányított, humanoid felépítésû, gigászi robotok. Ezek a combotok moduláris felépítésûek, ami azt jelenti, hogy a részeik cserélhetõk, az elvégzendõ feladatnak megfelelõen. Amit eddig az emberiség a mozgásról tudott, mindet beléjük programozta, ezáltal csaknem tökéletesen utánozzák egy ember mozgását. Azok a fegyverek mellett amelyekkel fel vannak vértezve, az emberiség minden eddigi fegyvere játékszernek mondható. A játék lényege tehát ezeknek a robotoknak az irányítása, de emellett más haderõnemek is elég fontosak maradtak ahhoz, hogy ne hanyagoljuk el õket. Mivel az értékes nyersanyag a barlangokban található, a rengeteg ellenséggel együtt. Mivel a combotok gigászi méretûek, nem férnek be a barlangokba, ezért a föld alatt a hagyományos haderõ az úr. A felszín felett, a repülni tudó gépek uralkodnak, mivel itt a mesterséges aszteroidák biztosítják az építkezési területet.

Összesen három hadjárat alatt ismerkedhetünk meg azzal, hogy végül is hogyan alakul az Angelus testvérek története. A küldetések elején az utánpótlás megteremtése a feladat, amelyet úgy érünk el, hogy felépítjük a megfelelõ épületet. A számunkra oly fontos nyersanyag, a lávatavakból nyerhetõ energia, amelyet az erre alkalmas jármûvel (Hoover Truck) gyûjthetjük be. Az erõtérrel védett területre kezdhetjük meg az épületek építését. A különbözõ jármûveket a jármûgyárban, a combotokat pedig az összeszerelõ üzemben állíthatunk elõ. Az egyik újítás a programban az elõépítés lehetõsége, ezáltal az eddigi valós-idejû stratégiai játékoktól eltérõen, nem kell minden pályán az épületeinket szinte elölrõl kezdve felépíteni. Ezáltal a játék elején történõ építkezések és gyártások, - az adott kezdeti energiamennyiség felhasználásával - igencsak gyorsított ütemben készülnek el. Ennek a különleges funkciónak a segítségével már az induláskor a valódi feladatra térhetünk rá, nem kell "bíbelõdni" az alap épületek felállításával, amely csak egyfajta "kolonc" volt minden játékosnak és csak arra volt jó, hogy általa több legyen a játékidõ. Emellett a funkció mellet van egy másik újítás, ami kiemeli a többi valós-idejû stratégiai játék közül, mégpedig az, hogy az egyes részfeladatok teljesítése után tapasztalati pontokat kapunk, ami precíz tevézésre és a veszteségek csökkentésére ösztönöz. Ezeket a tapasztalati pontokat a következõ feladat elõtt oszthatjuk szét a személyzet körében. Így nem az egyes egységeink kapják az elõléptetést, hanem a jármûvek személyzete, a combot pilóták és az épületek személyzete. Minden egységnek és épületnek szüksége van személyzetre. A személyzet kiolvasztását a különleges Cryo-k végzik. Egyedül a combot-pilóták kiolvasztását kell nekünk kezdeményeznünk. Mivel ilyen elengedhetetlen az emberi tényezõ, ezért a bázisunkra igen kártékony lehet a ránk kilõtt neutronbomba, ami elpusztít minden élõlényt. A pusztítás által okozott "intelligencia elvesztését" hivatott csökkenteni a AI (Mesterséges Intelligencia) központok építése.

Mind a három társaság ugyanabból a forrásból kezdte a combotok fejlesztését, de az idõ elteltével a fejlesztési irányok igencsak eltértek egymástól. A Ritmech eszközei teljesen kiegyensúlyozottak az egyes fegyverrendszerek használata terén. A Mil-Agro kifejezetten nyers erõt igencsak kiemelõ fegyvereket részesít elõnyben. A Neuropa mind a kettõtõl igen csak eltér, mivel õk a Hedoth technológiát alkalmazzák igen nagy hatékonysággal. Mind a három társaság combot-alkatrészei teljesen kompatibilisek egymással, ezáltal lehetõség nyílik arra, hogy megszerezzük az ellenséges technológiát és ennek mintájára mi is hasonlókat gyártsunk. Ezeknek a megszerzése nem annyira egyszerû, mivel a combotok az elpuszilásuk elõtt megsemmisítik önmagukat. Ezért csak a közelharcban tudjuk megszerezni az ellenfél technológiáját, mégpedig olyan módón, hogy egyszerûen levágjuk az adott eszközt az ellenfél combotjáról. Az így megszerzett eszközt - a bázisra történõ bevitele után - beépíthetjük az egyik combotunkba, vagy kutatás céljából megvizsgáltathatjuk. A combotpilóta képes a harcközben leválasztani a karokat, így ha sikeresen levágtuk az ellenfél egyik karját, azt nyugodtan felvehetjük és használhatjuk a harcban. Persze a pilóta nincsen hozzánõve a combothoz, így akár el is hagyhatja és átszállhat egy másikba. Akadnak olyan küldetések, amelyeket csak ilyen módszerekkel tudunk megoldani, mivel se gyártási, se javítási lehetõségünk nincsen.

A hadjáratok során különféle idegenekkel és a hozzájuk tartózó épületekkel is találkozunk. Ezek igencsak megbonyolítják a történetet, de ezáltal lehetõséget nyújtanak arra, hogy a két szembenálló fél harcát kihasználjuk a saját javunkra. A játékmenet egyszerre 3 helyszínen folyik: a levegõben, a felszínen és a föld alatt. Mindegyik helyszín tulajdonképpen egy külön játéknak számit, szerencsére a program AI-je nagymértékben megkönnyíti a munkánkat. Lehetõségünk van az egységeinknek különleges parancsokat adni. Ilyen pl. Tether, aminek kiadása a egységünk a kijelölt helytõl, csak egy darabig megy el és miután elpusztította az ellenséget, visszatér az elõzõ pozíciójába. Összesen kilenc féle parancsot adhatunk az egységeinket, ami által könnyedén irányíthatjuk õket. A három szint között átjárást különbözõképpen oldották meg: a felszín és az aszteroidák között az "átjárás" repülõk, vagy teleport segítségével történhet; a felszín és a földalatti szint között egy lift biztosítja az átjárást, amin keresztül kisebb jármûvek mehetnek fel, illetve le.

A program engine-je Glide-ra optimalizált, ezzel a 3dfx tulajdonosok elõnyben. Természetesen a program támogatja a D3D-t és az OpenGL-t is. Aki teheti, ne hagyja ki azt az élményt, amit a játék nyújt.